期刊 :Oxidative medicine and cellularlongevity;影响因子: 8.4274
原文链接:DOI: 10.1074
研究对象:脑缺血
研究目的:脑缺血的发病机制以及脑缺血生物标志物研究
研究手段:生物信息学分析等
研究内容及结论:近年来,代谢组学分析已被广泛应用于脑缺血研究。本文介绍了脑缺血代谢组学研究的zuì新进展。讨论了脑缺血的主要技术、模型、动物和生物标志物。在MBRole网站和KEGG数据库的分析帮助下,使用大鼠脑缺血中改变的代谢物进行代谢途径富集分析。研究结果确定了与脑缺血相关的主要代谢途径,并进一步构建了一个代谢网络。这些结果将为阐明脑缺血的发病机制以及脑缺血生物标志物的发现提供有用的信息。
利用生物信息学分析对总结的120种显著改变的脑缺血代谢物进行功能富集分析,该服务由北京百泰派克生物科技提供。数据表明,大鼠脑缺血的生物标志物主要与TCA循环、嘧啶代谢、酪氨酸代谢、氧化磷酸化和神经活性配体-受体相互作用等途径有关。基于KEGG数据库中的通路富集分析和相关信息,构建了大鼠脑缺血代谢网络。
参考文献:Liu M, Tang L, Liu X, et al. An evidence-based review ofrelated metabolites and metabolic network research on cerebralischemia[J]. Oxidative medicine and cellular longevity, 2016,2016.
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代谢组学生物信息学分析
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(4)基于10x Genomics的单细胞分析平台
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采用基于Fluidigm Helios流式细胞仪(Mass Cytometry Systemfor Single CellAnalysis)用于单细胞质谱分析,该平台能够完成包括单细胞捕获、cDNA合成、实时定量PCR分析、目标区域扩增以及质谱流式细胞分析;
(6)基于高精度质谱的免疫多肽组学及免疫学检测平台
基于高精度质谱的免疫多肽组学及免疫学检测平台,能够完成包括多肽分离、纯化、合成、质谱分析、免疫学检测以及分子相互作用研究;
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